המרכיב המהפכני ביותר ברפורמה הוא הקמתם של מכוני בקרה עצמאיים לשם בקרה מקצועית על עמידה בתקנות הנוגעות לתכן המבנה. רבים מתחומי התכן לא נבדקו עד היום בוועדות המקומיות ולא היו נתונים לבקרה, בעיקר בשל העדר הנחיות ברורות או ידע. מכוני הבקרה, שיוקמו כגוף בודק בשוק החופשי יעמדו תחת ביקורת של משרד הפנים ושל הרשות הלאומית להסמכת מעבדות - גוף בודק ממשלתי, שאחראי לבדיקת מעבדות וגופים בהתאם לנורמות בין לאומיות.

מכוני הבקרה יהיו הזרוע המקצועית של רשויות הרישוי בתחומים שאינם בעלי השלכה מרחבית, ויהיו אחראים לבדוק בין היתר את תחומי הקונסטרוקציה, האוורור והחשמל, בהתאם לתקנות הבנייה ולקוד הבנייה. בדיקת גובה המבנה, קווי הבניין, חזיתות ותחומים דומים אחרים יישארו באחריותם של מהנדס העיר ושל אנשיו. גם הגורמים המאשרים - הג"א, כיבוי אש, משרד הבריאות ואחרים, יסמיכו נציגים במכוני הבקרה שישמשו זרוע אישור שלהם. הבדיקות והאישורים של הגורמים המאשרים ייעשו במסגרת בדיקות המכונים, ויהפכו את מכוני הבדיקה ל-one stop shop.

מכוני הבקרה יבצעו, לראשונה, בקרת ביצוע מקצועית ואיכותית על איכות הבנייה באתר, בהתאם לתקנות ולחוקי התכנון והבנייה. הם עתידים לתרום רבות לקיצור ולייעול הליכים, ולשיפור איכות הבנייה בישראל. הכנסת מכוני הבדיקה לתהליך הרישוי אינה צפויה להאריך את התהליך הקיים, ועשויה להפחית ליקויי בנייה שיחסכו למשק מיליוני שקלים המוקצים כיום לתיקון טעויות וכשלים.